日常用途
乾清宫是皇帝处理日常政务，批阅各种奏章的地方，后来还在这里接见外国使节。
乾清宫宫灯
清朝康熙皇帝以前，这里沿袭明制，清朝顺治、康熙年间，乾清宫与政务关系相当密切，皇帝在这里读书学习、批阅奏章、召见官员、接见外国使节以及举行内廷典礼和家宴。自雍正皇帝移住养心殿以后，这里即作为皇帝召见廷臣、批阅奏章、处理日常政务、接见外藩属国陪臣和岁时受贺、举行宴筵的重要场所。一些日常办事机构，包括皇子读书的上书房，也都迁入乾清宫周围的庑房，乾清宫的使用功能大大加强。
停灵之所
清朝时，乾清宫还是皇帝死后停放灵枢的地方。即使皇帝死在其它地方，也要先把他的灵枢（也称梓宫）运往乾清宫停放几天，再转至景山内的观德殿，最后正式出殡。
顺治皇帝死在养心殿，康熙皇帝死在畅春园，雍正皇帝死在圆明园，咸丰皇帝死在避暑山庄，他们的灵枢都曾被运回乾清宫，停放在这里并按照规定举行祭奠仪式。
举行家宴
除夕是中国人传统的团圆日，普通百姓都要在这天吃顿团圆饭。对于身居皇宫大内的清朝皇帝来说，也不能脱离人之常情，他们也要在除夕和皇后及众妃嫔们一起在乾清宫举行家宴。因为皇帝与他的后妃们平时都不同吃，所以相对于民间百姓，乾清宫家宴更有特殊的团聚意义。
需要注意的是，清朝皇帝与皇子及宗室诸王的宗室宴（亲藩宴）是在元旦次日举行的，它并不是典制上的乾清宫家宴。宫中无论是典礼还是宴会，从未出现过男女欢聚一堂的场面，只有皇帝一个男性能与宫中女性一同饮宴，皇子作为他们的儿子（除了幼龄以外）也不得参与。其实，相对于民间的团圆饭，没有能真正称得上家宴的宫廷宴会。
从十二月二十四日开始，乾清宫就开始营造过年的气氛了。乾清宫丹陛左右就开始安设万寿天灯，每天晚上天灯都要点亮。在万寿灯后面，左右都悬挂万寿宝联，每幅宝联两面都用金丝绣上联句。万寿灯光映照在宝联及其金字上，使得黑暗的夜晚特别透亮，营造出浓烈的新年来临的喜悦气氛。
乾清宫家宴前夕，相关人员忙忙碌碌，按照礼制布置宴会现场。乾清宫檐下陈设了中和韶乐，乾清门内陈设了丹陛大乐，交泰殿檐下陈设了中和韶乐。在乾清宫内，每人一张的宴桌按照严格的等级秩序排列：皇帝宝座前设金龙大宴桌，左侧地平上，面西座东摆着皇后的宴桌，其余嫔妃的宴桌排在左右。他们所用的餐具也不一样。
酉时（下午6点），皇帝入宴，皇后等人在座位处向皇帝行礼，礼毕，皇后等人各入座进馔。过了一会，皇帝与后妃们开始欣赏承应宴戏。他们一边欣赏演出，一边进果，进酒，皇帝进酒时，后妃们各出座，跪拜。承应宴戏演出结束后，后妃们出座谢宴，行跪拜礼，皇帝起座离开，皇后以下各还本宫。在以上的宴会过程中，各种音乐依次演奏。
乾清宫家宴极尽奢华，据乾隆四十四年（1779年）乾清宫家宴档案，皇帝的大宴桌所摆膳食一开始就有109碗（盘），加上宴礼中所进汤膳、酒宴，合计可达153品。这些美味佳肴，虽然有的在宴会后作为赏赐，但仍会产生极大的浪费。
除夕之外，凡遇皇帝万寿等节日，乾清宫也要举行家宴。
•密建皇储
皇位继承是皇帝制度的核心问题。自西周到清朝初期，册立太子是皇位继承的正统做法。这种制度依据宗法制度嫡长继承、顺序嗣位的原则，皇后所生的长子为太子，如长子早死，即立长子之子为太孙，无子再由皇帝的嫡次子顺序继承。如果皇后无子，才考虑册嫔妃所生的长子为太子。皇帝无子则在近支亲属中选立太子。
清朝从康熙朝开始，沿用中原历代王朝立嫡长子的做法确定皇位继承人。康熙十四年（1675年）下诏册立嫡长子胤礽为皇太子。康熙帝多子，在位时间又长，过早地公开册立太子，造成了康熙帝和太子间、太子和诸皇子间一场场残酷而痛苦的矛盾和纷争。
从康熙五十一年（1712年）第二次废皇太子后，康熙皇帝再没有公开建储，致使康熙死后雍正帝即位成为一大历史疑案。无论历史真相如何，康熙诸子争夺皇位给予雍正皇帝深刻的教训。雍正元年（1723年）八月，雍正皇帝废弃了公开建储制，宣布实行秘密建储。雍正帝在乾清宫西暖阁召见王公大臣，共议秘密建储制，诸王大臣均无异议。雍正帝遂将密封的写有继位人姓名的锦匣收藏于“正大光明”匾后。后来，雍正帝又另书密封一匣，随时带在自己的身边。
雍正十三年（1735年）八月己丑，58岁的雍正皇帝驾崩，皇亲国戚和朝廷大臣们虽然为失掉了皇帝而悲伤，但并不为谁来继承皇位而担忧，雍正皇帝早在十三年前就已经秘密指定了皇位继承人。庄亲王允禄等人打开了雍正皇帝秘密建储的锦匣，上面赫赫写着由皇四子宝亲王弘历继位，弘历成为清朝第一个以秘密建储制继位的皇帝，也就是乾隆皇帝。
雍正密建皇储的用意何在？第一，预先指定继承人，保证了皇位继承的有序。第二，不明确公布皇位继承人，阻止了继承人形成权力集团。因此雍正皇帝故意布疑阵，在各方面都使四阿哥弘历、五阿哥弘昼分庭抗礼，让人相信他们都有即位的可能。
密建皇储制度，削弱了宗法制在皇位继承问题上的法定支配作用，扩大了对皇帝候选人的选择范围。选立继位人之权全由皇帝一人掌握，选立继位人不以嫡、庶、长、幼为条件，而以是否具有统治才能为原则：这是对皇帝制度的重大改革。
乾隆帝继位后，在对历朝历代的建储法详加比较剖析后，认定秘密建储最为美善，进一步将秘密建储确定为神圣不可更改的家法。乾隆以后，嘉庆、道光、咸丰三位皇帝，都是按秘密建储制继承皇位的。
